SARS CoV-2، یک کروناویروس خاص

از زمان اولین مورد بیماری کرونا، در دسامبر 2019، بیماری همه گیر به میلیون ها نفر در سراسر جهان سرایت کرده است.این همه گیری جهانی رمانسندرم حاد تنفسی شدید ویروس کرونا 2 (SARS-CoV-2)یکی از قانع‌کننده‌ترین و نگران‌کننده‌ترین بحران‌های بهداشت جهانی در عصر حاضر است که تهدیدهای بزرگی برای جهان به شمار می‌رود و همه جنبه‌های زندگی بشر را تحت تأثیر قرار می‌دهد.[1]
ویروس‌های کرونا ویروس‌های RNA تک رشته‌ای با حس مثبت در خانواده Coronaviridae هستند که دارای طیف وسیعی از میزبان‌ها مانند انسان، خفاش، شتر و گونه‌های پرندگان از جمله دام و حیوانات همراه هستند که تهدیدی برای سلامت عمومی هستند. 1 کروناویروس‌ها در زیرخانواده Orthocoronavirinae طبقه‌بندی می‌شوند که بر اساس تفاوت‌ها در توالی پروتئین به چهار جنس تقسیم می‌شوند: a-coronavirus، b-coronavirus، g-coronavirus و d-coronavirus.ویروس های a-coronavirus و b-coronaviruses فقط پستانداران را آلوده می کنند، در حالی که ویروس های g-coronavirus و d-coronavirus در درجه اول پرندگان را آلوده می کنند، اگرچه برخی از آنها می توانند پستانداران را آلوده کنند.HCoV-229E،

oV-OC43، HCoV-NL63، HCoV-HKU1، SARSCoV، MERS-CoV، و SARS-CoV-2 هفت ویروس کرونا هستند که برای آلوده کردن انسان‌ها شناسایی شده‌اند.در میان آنها، SARSCoV و MERS-CoV که در سال‌های 2002 و 2012 در جمعیت انسانی ظاهر شدند، بسیار بیماری‌زا هستند.در حالی که سویه های ویروس کرونای انسانی (HCoV)-229E، HCoV-NL63، HCoV-OC43، یا HCoV-HKU1 در حال گردش در جمعیت انسانی تنها باعث سرماخوردگی معمولی می شوند، 7 سندرم حاد تنفسی شدید کروناویروس 2 (SARS-CoV2)، عامل ایجاد کننده بیماری کووید-۱۹ یک ویروس جدید ب-کرونا است که در اواخر سال ۲۰۱۹ ظاهر شد و منجر به مرگ‌های ویرانگر شده است.علائم اولیه ازکووید 19مانند SARS-CoV و MERS-CoV: تب، خستگی، سرفه خشک، درد بالای قفسه سینه، گاهی اوقات اسهال و تنگی نفس.برخلاف گذشتهعفونت های کروناویروس (CoV)انتشار سریع جهانی، نرخ انتقال بالا، زمان کمون طولانی‌تر، عفونت‌های بدون علامت بیشتر و شدت بیماری SARS-CoV-2 نیازمند دانش عمیق در مورد استراتژی‌های فرار ایمنی ویروسی است.

مانند سایر کروناویروس‌های انسانی (SARS-CoV-2، MERS-CoV)، SARSCoV-2 نیز دارای ژنوم RNA تک رشته‌ای با حس مثبت با اندازه حدود 30 کیلوبایت است.همانطور که در شکل 1 نشان داده شده است، پروتئین‌های نوکلئوکپسید ویروسی (N) ژنوم را به یک کمپلکس ریبونوکلئوپروتئین (RNP) بزرگ بسته‌بندی می‌کنند، که سپس توسط لیپیدها و پروتئین‌های ویروسی S (اسپیک)، M (غشاء و فرآیندهای غشایی) و E (پوشش) پوشانده می‌شود.انتهای 50 ژنوم دارای دو قاب بزرگ خواندن باز (ORFs)، ORF1a و ORF1b است که پلی پپتیدهای pp1a و pp1b را کد می کند، که به 16 پروتئین غیرساختاری (NSPs) تولید می شوند که شامل هر جنبه ای از تکثیر ویروسی توسط پروتئازهای ویروسی NSP3 و NSP5 می شود. به ترتیب یک دامنه پروتئاز شبیه پاپائین و یک دامنه پروتئاز 3C مانند. 9 انتهای 30 ژنوم پروتئین های ساختاری و پروتئین های جانبی را کد می کند، که ثابت شده است که ORF3a، ORF6، ORF7a و ORF7b پروتئین های ساختاری ویروسی هستند. در تشکیل ذرات ویروسی و ORF3b و ORF6 به عنوان آنتاگونیست اینترفرون عمل می کنند.با توجه به حاشیه نویسی فعلی بر اساس شباهت توالی به سایر ویروس های b-coronavirus، SARS-CoV-2 شامل پیش بینی شش پروتئین جانبی (3a، 6، 7a، 7b، 8، و 10) است.با این حال، هنوز همه این ORF ها به صورت تجربی تایید نشده اند، و تعداد دقیق ژن های کمکی SARS-CoV-2 هنوز محل بحث است.بنابراین، هنوز مشخص نیست که کدام ژن های کمکی واقعاً توسط این ژنوم فشرده بیان می شوند.[2]
تست های بسیار حساس و ویژه برای شناسایی و مدیریت بیماران COVID-19 و همچنین اجرای اقدامات کنترلی برای محدود کردن شیوع بسیار مهم است.آزمایش‌های مولکولی نقطه مراقبت (POC) این پتانسیل را دارند که در مقایسه با روش‌های تشخیصی مبتنی بر آزمایشگاه، امکان تشخیص زودتر و جداسازی موارد تایید شده SARS-CoV-2 را فراهم کنند و در نتیجه انتقال خانگی و جامعه را کاهش دهند.
[1] تأثیر بالینی و عملیاتی تشخیص سریع SARS-CoV-2 در نقطه مراقبت در بخش اورژانس
[2] نبرد بین میزبان و SARS-CoV-2: ایمنی ذاتی و راهبردهای فرار ویروسی